Например, Бобцов

ПОДХОДЫ К АНАЛИЗУ ВЗАИМОСВЯЗИ ГЕНОТИПА И ФЕНОТИПА ПРИ ПОМОЩИ QTL-АНАЛИЗА

Аннотация:

Описаны методы QTL-анализа в исследовании влияния генотипа на фенотип. QTL-анализ основан на внутривидовой изменчивости, которая приводит к количественным изменениям исследуемого признака. С его помощью можно выявлять участки хромосом, где расположены гены или группы тесно сцепленных генов, обнаруживающих значительное количественное влияние на признак, и оценить такое влияние. Необходимым условием проведения QTL-анализа является построение карты сцепления. Карты сцепления (молекулярно-генетические карты, linkage-карты) отражают позицию маркеров и относительные генетические расстояния между маркерами вдоль хромосом. Исходные данные для исследования получены лабораторией молекулярной генетики врожденного иммунитета Петрозаводского государственного университета. Суть проекта, проводимого совместно с лабораторией, заключалась в исследовании массивов данных генетической информации для выявления и моделирования взаимосвязей между генотипом и фенотипом биологических организмов. В эксперименте использованы гибриды мышей второго поколения линий C57BL/6 и MOLF. Генотипирование и фенотипирование проводилось на основе данных секвенирования (определение аминокислотной и нуклеотидной последовательности) матричной РНК. Практическим результатом работы является выявление цепочек активированных генов, под влиянием которых происходит отмирание клеток исследуемых тканей и органов (апоптоз). Для поиска таких генов использован метод генетического анализа, т.е. скрещивались особи противоположного фенотипа и анализировалось получаемое потомство. Использованы методы прикладной и математической статистики. Результатом исследования стала разработанная методика анализа связи фенотипа и генотипа, с помощью которой выявлены группы значимых фенотипов.

Ключевые слова:

Статьи в номере